秦琼拒绝参加玄武门兵变的原因主要有以下几点：
忠诚于李渊：
秦琼作为李渊手下的将领，忠诚于李渊，不愿意看到李渊的儿子们互相残杀。
不愿参与皇权斗争：
秦琼不想卷入李世民和李建成之间的权力之争，他只想为唐朝的稳定和安宁做出贡献。
身体原因：
秦琼因长期战斗积累下很多伤病，健康状况不佳，玄武门之变时他已体弱多病。
战略考虑：
秦琼可能预见到李建成若发现被设计，会奋力反抗，所以他选择留在后方牵制李建成，为李世民争取时间。
忠义之人：
秦琼是一个忠义之人，他忠于江山社稷和国家，但不会因为个人去动摇国家的根本。
政治中立：
秦琼在夺嫡之争中保持中立，既不为李世民也不为李建成效力，以保持自己的政治清白。
综上所述，秦琼拒绝参加玄武门兵变是出于对国家和民族利益的考虑，以及他个人的健康状况和政治立场