职能机关是指那些直接履行政府的政治、经济、文化、教育、卫生、科技、社会服务职能的行政机关。它们是行政组织结构中直接承担独立行政管理事务的工作部门，具有明确而独立的责任目标。在中国，职能机关包括中央和地方两级，具体如下：
中央职能机关
国务院及其组成部门，如自然资源部、人力资源和社会保障部、交通运输部、财政部、生态环境部、司法部、商务部、住房和城乡建设部、国家发展和改革委员会、国家卫生健康委员会、中国人民银行和审计署等。
国务院直属机构，如中国证券监督管理委员会、国家税务总局、国家市场监督管理总局、国家国际发展合作署、国家广播电视总局、海关总署、国家体育总局、国家统计局、国家医疗保障局、国家知识产权局、国家信访局等。
国务院部委管理的国家局，如公安部管理的国家移民管理局、交通运输部管理的国家铁路局、中国人民银行管理的国家外汇管理局、文化和旅游部管理的国家文物局、国家发展和改革委员会管理的国家能源局、自然资源部管理的国家林业和草原局、应急管理部管理的国家矿山安全监察局以及国家发展和改革委员会管理的国家数据局等。
地方职能机关
省（自治区、直辖市、港澳特区）、市（州、自治州、地区）、县（旗、自治县）政府负责专业行政管理的厅（局）、处、科等。
职能部门，如公安局、财政局、地税局、国有资产管理局、审计局、农业局、水产局、林业局、水务局、城管局、房产局、商业局、粮食局、卫生局等。
派出机关，如街道办事处、公安的派出所、政府的驻外办事处等。
职能机关是政府组织系统中数量最多、拥有较多直接行政管理权限的机构类型，直接与社会民众发生关系。