荠菜主要有 两种品种，分别是 板叶荠菜和 散叶荠菜。
板叶荠菜，也叫大叶荠菜，是上海市地方品种。其植株塌地生长，叶片浅绿色，大而厚，叶长约10厘米，宽2.5厘米，有18片叶左右。板叶荠菜味淡，糯性，适合在秋季播种，播种后约40天可收获。
散叶荠菜，也叫百脚荠菜、慢荠菜、花叶荠菜、小叶荠菜、碎叶荠菜等。其植株塌地生长，开展度18厘米，叶片颜色较深，味浓，粳性。散叶荠菜耐热性好，但耐寒性中等，适合春季栽培。在低温下，叶片会逐渐变深，带有紫色。
此外，有些资料提到荠菜还有尖叶种和圆叶种之分，尖叶种即花叶荠菜，叶色淡，叶片小而薄；圆叶种即板叶荠菜，叶色浓，叶片大而厚。
综合来看，荠菜的主要品种为板叶荠菜和散叶荠菜两种，而尖叶种和圆叶种可以视为这两种品种的具体分类。