从新庄到南京南站的时间取决于您选择的交通方式。以下是几种可能的交通方式及其预计所需时间：
1. 地铁：
乘坐地铁3号线从南京站到南京南站，全程大约需要27到28分钟，具体时间取决于地铁的运行状况。
2. 出租车：
如果路况良好，不遇到早晚高峰时段的交通拥堵，打车从新庄到南京南站大约需要40分钟左右。
在早晚高峰时段，尤其是周一和周二，由于隧道内容易堵车，时间可能会更长。
3. 自驾或打车（通过新庄立交到九华山隧道，再到集庆门隧道）：
如果路况良好，不遇到交通拥堵，自驾或打车大约需要1小时左右。
在早晚高峰时段，时间可能会更长，建议选择地铁以减少不确定性。
请根据您的实际情况选择最合适的交通方式。需要注意的是，这些时间仅供参考，实际旅行时间可能会因当天的交通状况而有所不同。建议您出发前查看最新的地铁时刻表或实时交通信息以获得更准确的出行时间