重庆的第二大城市是 万州区。万州区位于三峡库区腹地，是重庆除了主城区以外最大的城市，一直位居重庆第二大城市的位置。万州区在历届重庆市委中都有重要地位，其区委书记通常由重庆市委常委兼任，显示出其在重庆市中的重要性。
万州区不仅是重庆的经济重镇，也是三峡库区的中心城市，具备成为重庆第二城的能力和战略性。从历史角度看，万州在未直辖之前与重庆一个等级，原名万县市，因三峡移民而有所没落，但目前已经发展得较好且发展速度很快。
此外，虽然涪陵区和江津区在经济实力上也有较强竞争力，但目前来看，万州区在区域面积和人口总量上仍具有优势，被认为是重庆第二大城市的主要竞争者。
综上所述，综合考虑各方面因素，万州区是重庆的第二大城市。