关塔那摩监狱位于古巴，主要基于以下几个原因：
历史原因
1898年，美国以“缅因号”事件为由，向西班牙宣战，并占领了关塔那摩湾，随后将古巴变为自己的殖民地。
1903年，古巴共和国独立后，美国迫使古巴同意无限期租用关塔那摩基地所在地区，租金非常低。
战略考虑
关塔那摩位于古巴东南部，三面环海，只有一面陆地，便于防守。
该地区是加勒比海的重要战略位置，控制着大西洋到墨西哥湾的入海口，是美国向南扩张的跳板。
反恐战争需要
“911事件”后，美国为了审讯抓捕的恐怖分子，在关塔那摩基地建立了监狱，由于不是美国本土，犯人不受美国法律保护。
政治因素
尽管古巴是一个独立国家，并且与美国关系紧张，但美国通过历史上的不平等条约，在古巴领土上建立了军事基地，并且这个租金非常便宜，几乎等同于免费。
地理优势
关塔那摩湾拥有优良的天然屏障，是美国重要的海军基地，同时，由于其地理位置，使得在此设立监狱可以方便地关押和审讯犯人。
综上所述，关塔那摩监狱之所以设在古巴，是由于一系列复杂的历史、战略和政治因素共同作用的结果