办理农村自建房房产证的流程通常包括以下几个步骤：
申请宅基地使用权
向村集体组织申请宅基地使用权，并取得国土部门颁发的集体土地使用权证书。
提交建房申请
向当地规划建设办提交房屋建设的报批手续。
实地勘察与审批
乡建办工作人员进行实地勘察，确认宅基地选址和面积符合要求。
提交相关资料，包括身份证明、宅基地使用权证明、房屋平面图等，进行申请。
审核与公示
乡建办审核通过后，将申请事项在村委会内进行公示，无异议后进行下一步。
领取房屋建设申请表
在乡建办领取并填写房屋建设申请表。
乡建办与乡主管领导审批
乡建办签字盖章后，递交至乡主管领导签字盖章，并核实同意。
规划建设局审批
将申请提交至县规划建设局进行审批。
房管局办理产权证
房屋建成后，向房管局申请不动产权登记，并提交相关资料，包括土地使用证、报建验收证明、房屋面积测绘报告等。
领取房产证
经过房管局审核，无异议后，领取房产证。
请注意，具体流程和所需材料可能因地区而异，建议咨询当地房管部门获取最新信息。需要提供的材料通常包括身份证明、宅基地使用权证明、房屋平面图、规划许可证等。