扣除绩效工资是否违法取决于多个因素，包括公司的政策、劳动合同的条款以及扣除绩效工资的原因。以下是一些关键点：
劳动合同约定
如果劳动合同中约定了具体的绩效工资标准，公司可以根据绩效考核来扣除绩效工资，这是合法的行为。
如果合同中没有约定绩效工资，公司不能单方面扣除工资。
法律规定
根据《劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者，不得克扣或无故拖欠。
《劳动合同法》第九十一条指出，用人单位克扣或无故拖欠劳动者工资是违法行为。
扣除条件
如果劳动者因个人工作失职等原因给公司造成损失，公司可以根据经济损失扣除部分工资，但不得超过劳动者当月工资的20%。
绩效考核制度必须经过民主制定程序、公示，并告知员工，由员工签字确认。
扣除绩效工资后，劳动者的月工资不得低于当地最低工资标准。
恶意扣除
如果公司恶意克扣绩效工资，这属于违法行为。
总结来说，公司在扣除绩效工资时必须遵守劳动合同和相关法律规定，并且扣除的原因和方式必须合理合法。如果扣除行为违反了上述条件，劳动者可以要求公司返还克扣的工资，并可提出劳动仲裁或法律诉讼来维护自己的权益