肉身菩萨的形成是一个复杂的过程，涉及多个方面的因素。以下是肉身菩萨形成的主要步骤和原因：
生前修行
肉身菩萨的形成与其生前的修行密切相关。许多肉身菩萨在生前修行非常严谨，有的在深山中苦修，有的入世行医，有的则是治身心于一处。他们通过长期的修行，达到了心体广大、内心清净的境界，身体机能也发生了变化，潜能显现，甚至有的能示现神通。
坐缸保存
和尚圆寂后，其遗体需要经过特殊的处理才能成为肉身菩萨。具体步骤包括：
遗体擦洗：将遗体擦洗干净。
装殓：将遗体盘成跏趺式装殓于特制的陶缸中。
密封保存：在遗体的周围塞满木炭，直至颈项，头脑部位放置石灰包，再合上缸盖涂以黄泥密封，置阴凉通风处存放。密封的陶缸隔绝空气，木炭吸取遗体内的水分使之脱水干瘪。
火化：一旦遗体腐烂散发异味，就将陶缸底部的发火孔掏开，引燃木炭火化。
妆漆与金粉
形成肉身后，还需要进行妆漆和金粉的处理，以将尸体与外界隔离，使其保存得更加长久。
愿心与慈悲
许多高僧大德在圆寂时选择将遗体火化，认为四大皆空，不着于相。而肉身菩萨则是在圆寂前嘱托要保留好遗体，这出自于慈悲度生的愿心。他们认为通过保留遗体，可以以身弘法，以身说教，以身度尘，接引众生。
综上所述，肉身菩萨的形成是生前修行、坐缸保存、妆漆与金粉处理以及愿心与慈悲等多种因素共同作用的结果。这些高僧大德通过严谨的修行和特定的保存方法，最终实现了肉身的不腐和长久保存。