在明清时期，尚书和巡抚的职位和权力有所不同。
职位等级
尚书：是中央六部的最高长官，从一品，相当于各国家部委的部长。
巡抚：是地方省级官员，正二品，主管一省的军政、民政等全面工作。
实际权力
尚书：虽然品级较高，但主要是中央决策和管理机构的主官，实际权力相对有限。
巡抚：作为地方封疆大吏，掌管一省全面事务，拥有较大的实际权力和影响力。
加衔情况
有时巡抚会加衔兵部侍郎，从而成为正二品官员，与尚书在品级上平起平坐。
综合以上信息，可以得出以下结论：
从职位等级上看，尚书高于巡抚。
从实际权力和影响力上看，巡抚的权力往往更大，尤其是在其辖区范围内。
因此，虽然尚书在职位上高于巡抚，但巡抚在实际权力和影响力方面通常更为显著。