阴阳家保护天明的根本原因在于他们希望通过他实现自己的阴谋。具体来说：
实现阴谋：
阴阳家（东皇太一）作为最高头领，带领阴阳家处处针对天明，保护他的同时也在利用他，目的是为了实现自己的终极目的。
保护大秘密：
天明身上有一个与阴阳家紧密相关的大秘密，即与阴阳家的幻音宝盒有关。月神失踪后，幻音宝盒也随之消失，阴阳家需要确保天明找到与他命中注定的人，以利用这股力量。
利用玉煞之力：
阴阳家还在天明身上种下了至宝（乾元玉煞），这是羲氏一族的力量，他们计划通过这股力量让天明展现更多能力，最终吞噬天明的力量，获得无敌的力量。
综上所述，阴阳家保护天明是为了利用他达到自己的目的，并保护他们的重要秘密和计划