蔡依林和周杰伦的分手原因主要有以下几点：
性格不合
蔡依林和周杰伦在性格上存在较大差异，蔡依林事业低谷时期，周杰伦帮助她打造性感路线，但成功后，周杰伦反对蔡依林的性感，导致两人产生矛盾。
两人的观点和发展方向不同，周杰伦希望到大陆发展，而蔡依林则认为不需要这些流量。
侯佩岑因素
周杰伦与侯佩岑的亲密照片流出后，尽管周杰伦解释是被要求拍照，但蔡依林选择相信，最终周杰伦提出分手。
有传言称周杰伦的母亲叶惠美反对两人交往，认为周杰伦若继续与蔡依林交往，事业不会有起色。
媒体压力
两人的恋情因媒体曝光和舆论压力而受到影响，尤其是周杰伦与侯佩岑去日本旅游被拍到后，周杰伦最终承认了恋情，但随后因压力过大与蔡依林分手。
健康问题
周杰伦无法忍受蔡依林频繁上厕所的问题，蔡依林比常人尿频，经常需要跑厕所，甚至在演唱会上也难以忍耐，不得不中途离场。
综合以上几点，蔡依林和周杰伦的分手原因主要包括性格不合、侯佩岑因素、媒体压力和健康问题。尽管两人曾经真心相爱，但最终还是因为多种因素选择了分开。