苗木合作社的设立需要遵循一定的流程和准备相应的材料，以下是主要的步骤和所需材料：
工商局注册
提交设立登记申请书；
全体设立人签名盖章的设立大会纪要；
全体设立人签名盖章的章程；
法定代表人、理事的任职文件和身份证明；
全体出资成员签名盖章的出资清单；
法定代表人签署的成员名册和成员身份证明复印件；
住所使用证明；
指定代表或者委托代理人的证明；
合作社名称预先核准申请书；
业务范围涉及前置许可的文件。
公安局备案
办理合作社公章。
质监局登记
办理组织机构代码证。
税务局登记
申领税务登记证。
银行开户
办理银行开户许可证。
林业部门许可
办理《苗木生产许可证》和《苗木经营许可证》。
其他注意事项
农民专业合作社的成员数必须要有5人以上（含5人），且农民成员不低于80%，团体（单位）成员不超过20%；
合作社法人营业执照不需要年检。
请根据当地的具体要求和流程准备相应的材料，并咨询当地工商行政管理局或其他相关部门获取最新的指导和帮助。需要注意的是，以上信息可能会随着政策的更新和变化而有所不同，因此建议直接咨询当地相关部门以获得最准确的信息