当员工在上下班途中遭遇交通事故并被认定为工伤时，根据《中华人民共和国社会保险法》和相关法规，单位应承担的赔偿项目主要包括：
停工留薪期内的工资：
员工因工伤需要暂停工作进行治疗时，单位应支付其工资福利待遇。
护理费：
如果员工因工伤需要护理，单位应支付相应的护理费用。
一次性伤残就业补助金：
根据员工的工伤等级和当地政府规定，单位可能需要支付一次性伤残就业补助金。
医疗费用：
单位应支付工伤治疗和康复所需的费用。
误工费：
单位应补偿员工因工伤导致的收入损失。
住院伙食补助费：
员工住院治疗工伤期间，单位应支付相应的伙食补助费。
交通费：
员工因工伤需要到外地就医时，单位应支付必要的交通费用。
住宿费：
若员工需要在外地就医，单位应支付住宿费用。
残疾赔偿金：
根据员工的工伤等级和上一年度城镇居民人均可支配收入计算，单位可能需要支付。
劳动能力鉴定费：
单位应承担劳动能力鉴定的费用。
需要注意的是，如果单位已经为员工缴纳了工伤保险，部分费用应由工伤保险基金支付。此外，如果交通事故责任方已经对员工进行了赔偿，单位在支付工伤赔偿时可能需要根据“就高不就低”的原则进行相应的调整，以避免重复赔偿。
具体的赔偿项目和金额需要根据员工的实际情况、工伤等级以及当地政府的相关规定来确定。如果单位拒绝支付赔偿，员工可以向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁