持有日本签证的旅行者，根据签证类型和有效期，可以免签或申请电子签证进入以下国家：
韩国
持有日本有效签证者，可免签证过境韩国，停留期限30天以内，但须有30天内离韩机票订单。
菲律宾
持有日本有效签证，有效期大于6个月的国内护照，返程或续程的机票，在移民局内没有违禁记录，免签入境最多可延长14天，最长可停留21天。
墨西哥
持有日本签证，入境停留目的为非劳务访问（旅游）的外国人，可直接前往墨西哥，在入境时出示护照及有效签证。
巴拿马
持有日本签发的多次有效、之前在颁发国使用过且剩余有效期不少于6个月的签证，或有上述国家及地区的居留卡，可免签进入巴拿马，停留期限最长为30天。
格鲁吉亚
持有格鲁吉亚飞往日本的机票，可以免签入境格鲁吉亚，最多停留90天。
新加坡
日本签证有效期在30天以上和持有新加坡飞往日本的机票，就能在新加坡免签停留96小时。
中国香港特区
在中国香港飞日本或日本飞中国香港的机票往返，可以在中国香港特区免签停留7天，无需港澳通行证。
洪都拉斯
持有日本签证、离境机票、酒店预订单，可以免签洪都拉斯（注意：该信息可能随时间变化，建议出行前确认最新政策）。
请注意，以上信息可能随时间变化，建议在计划旅行前，通过官方渠道确认最新的签证政策。